یکشنبه 4 آذر 1403
[Archive]
دوره 22، شماره 6 - ( 3-1403 )
جلد 22 شماره 6 صفحات 506-495 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Ethics code: IR.SKU.REC.1402.020
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ahmadi K, Reiisi S, Habibi Z. Comparison of the gene expression profiles of endometrial and trophoblastic cells in women with recurrent miscarriage: A bioinformatics approach. IJRM 2024; 22 (6) :495-506
URL: http://ijrm.ir/article-1-3136-fa.html
URL: http://ijrm.ir/article-1-3136-fa.html
مقایسه پروفایل بیانی اندومتریال و سلول‌های تروفوبلاست در زنان با عارضه سقط مکرر: یک آنالیز بیوانفورماتیک. International Journal of Reproductive BioMedicine. 1403; 22 (6) :495-506
چکیده: (228 مشاهده)
مقدمه: سقط مکرر (RM)، در بیشتر از 50% بیماران، بدون علت خاصی رخ می‌دهد و باعث مشکلات جسمی و روانی در زنان می‌شود. برای یک بارداری موفق پذیرش اندومتریوم و همچنین تهاجم سلول‌های تروفوبلاست جنین به درون اندومتریوم نیاز است.
هدف: هدف از این مطالعه بیوانفورماتیکی استفاده از تحلیل‌های محاسباتی برای شناسایی ژن‌های کلیدی و مسیرهای مرتبط در سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست مشتق‌شده از نمونه‌های RM بود.
مواد و روش ها: در این مطالعه بیان افتراقی ژن‌ها در سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست به ترتیب بر اساس مجموعه داده‌های GSE165004 و GSE76862 توسط بسته limma در نرمافزار R بررسی شد. سپس ژن‌های همپوشان بین دو مجموعه داده انتخاب و تحلیل مسیر هویتشناسی ژنی و دایرهالمعارف ژن و ژنوم کیوتو انجام شد. در ادامه ژن‌های همپوشان برای ساخت یک شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین و انتخاب ژن‌های کلیدی ادغام شدند.
نتایج: در مطالعه حاضر، 41 ژن همپوشان بین سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست مشاهده شد و تجزیه و تحلیل‌های بعدی برای ژن‌های همپوشان و غیرهمپوشان انجام گرفت. تحلیل دایرهالمعارف ژن و ژنوم کیوتو نشان داد که ژن‌های همپوشان به طور قابل توجهی در آبشارهای انعقادی و کمپلمان، پرتوانی سلول‌های بنیادی، بیوسنتز هورمون استروئیدی، و سنتز و تجزیه اجسام کتون غنی شده‌اند. تحلیل هویتشناسی ژنی نشان داد که ژن‌ها اغلب در چرخه سلولی، آپوپتوز و تقسیم سلولی غنیشده بودند. علاوه بر این ده ژن کلیدی شامل IRS1، FGF2، MAP2K6، MAPK1، MAPK3، MAPK8، MAPK9، PLK1، PRKACA و PRKCA از شبکه PPI شناسایی شدند.
نتیجه گیری: در این مطالعه ژن‌های کلیدی و مسیرهای مولکولی بالقوه را در زمینه ایجاد RM شناسایی کرد که می‌تواند بینش جدیدی برای تعیین مکانیسم‌های بالقوه و استراتژی‌های مداخله‌ای مرتبط با سقط جنین ارائه دهد.
هدف: هدف از این مطالعه بیوانفورماتیکی استفاده از تحلیل‌های محاسباتی برای شناسایی ژن‌های کلیدی و مسیرهای مرتبط در سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست مشتق‌شده از نمونه‌های RM بود.
مواد و روش ها: در این مطالعه بیان افتراقی ژن‌ها در سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست به ترتیب بر اساس مجموعه داده‌های GSE165004 و GSE76862 توسط بسته limma در نرمافزار R بررسی شد. سپس ژن‌های همپوشان بین دو مجموعه داده انتخاب و تحلیل مسیر هویتشناسی ژنی و دایرهالمعارف ژن و ژنوم کیوتو انجام شد. در ادامه ژن‌های همپوشان برای ساخت یک شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین و انتخاب ژن‌های کلیدی ادغام شدند.
نتایج: در مطالعه حاضر، 41 ژن همپوشان بین سلول‌های آندومتر و تروفوبلاست مشاهده شد و تجزیه و تحلیل‌های بعدی برای ژن‌های همپوشان و غیرهمپوشان انجام گرفت. تحلیل دایرهالمعارف ژن و ژنوم کیوتو نشان داد که ژن‌های همپوشان به طور قابل توجهی در آبشارهای انعقادی و کمپلمان، پرتوانی سلول‌های بنیادی، بیوسنتز هورمون استروئیدی، و سنتز و تجزیه اجسام کتون غنی شده‌اند. تحلیل هویتشناسی ژنی نشان داد که ژن‌ها اغلب در چرخه سلولی، آپوپتوز و تقسیم سلولی غنیشده بودند. علاوه بر این ده ژن کلیدی شامل IRS1، FGF2، MAP2K6، MAPK1، MAPK3، MAPK8، MAPK9، PLK1، PRKACA و PRKCA از شبکه PPI شناسایی شدند.
نتیجه گیری: در این مطالعه ژن‌های کلیدی و مسیرهای مولکولی بالقوه را در زمینه ایجاد RM شناسایی کرد که می‌تواند بینش جدیدی برای تعیین مکانیسم‌های بالقوه و استراتژی‌های مداخله‌ای مرتبط با سقط جنین ارائه دهد.
نوع مطالعه: Original Article |
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
