پنجشنبه 13 دی 1403
[Archive]
دوره 13، شماره 12 - ( 9-1394 )
جلد 13 شماره 12 صفحات 764-755 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Shahsavari S, Noormohammadi Z, Zare Karizi S. Association of kinase insert domain-containing receptor (KDR) gene polymorphism/ haplotypes with recurrent spontaneous abortion and genetic structure. IJRM 2015; 13 (12) :755-764
URL: http://ijrm.ir/article-1-614-fa.html
URL: http://ijrm.ir/article-1-614-fa.html
شهسواری شیوا، نورمحمدی زهرا، زارع کاریزی شهره. ارتباط پلی مورفیسم/هاپلوتایپ های ژن KDR با سقط مکرر خودبخودی و ساختار ژنتیکی. International Journal of Reproductive BioMedicine. 1394; 13 (12) :755-764
1- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
2- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران ،marjannm@yahoo.com
3- گروه زیست شناسی، واحد پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران
2- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران ،
3- گروه زیست شناسی، واحد پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران
چکیده: (3143 مشاهده)
مقدمه: سقط مکرر خودبخودی یکی از بیماری هایی است که می تواند باعث ایجاد مشکلات جسمی، روانی و اقتصادی برای افراد و جامعه شود. به تازگی تعدادی از پلی مورفیسم های ژن گیرنده دومین داخلی کینازی (KDR) که می تواند باعث به خطر افتادن جنین مادران باردار شود مورد بررسی قرار گرفته است.
هدف :ریسک پلی مورفیسم های ژن KDRدر زنان ایرانی با سقط مکرر ایدیوپاتیک مورد بررسی قرار گرفته است.
مواد و روش ها: مطالعه از نوع مورد-شاهد است. 100 بیمار سقط مکرر خود به خودی ایدیوپاتیک با حداقل دو سقط متوالی قبل از هفته 20 حاملگی با کاریوتیپ نرمال مورد مطالعه قرار گرفت. همچنین 100 زن با حداقل یک حاملگی طبیعی به عنوان گروه کنترل در این مطالعه در نظر گرفته شد. دو SNP عملکردی واقع در ژنKDR شامل rs1870377 (Q472H) و (rs2305948 (V297I و همچنین یک SNP tag در اینترون (rs6838752) توسط واکنش زنجیره ایی پلی مرازی بر پایه چند شکلی طول قطعه محدودالاثر (PCR-RFLP) مورد تجزیه و تحلیل ژنوتایپی قرار گرفت. فراوانی هاپلوتایپ ها برای ژنوتیپ های سه SNP برآورد شد. تجزیه و تحلیل ساختار ژنتیکی و خوشه بندی K-means به منظور بررسی تنوع ژنتیکی انجام شد.
نتایج: SNPعملکردی (rs1870377)پیوستگی بالایی با(rs6838752) tag SNP (D´ value=0.214; χ2 = 16.44 p=0.000) نشان داد. خوشه بندی K-means K=8 را به عنوان بهترین تعداد زیر گروه های ژنتیکی ایده ال برای نمونه های مورد مطالعه شبیه به نتایج تجزیه و تحلیل خوشه ای Neighbor Joining نشان داد.
نتیجه گیری: در این مطالعه، فراوانی آللی و ژنوتیپی ارتباطی با سقط مکرر خودبخودی بین افراد بیمار و کنترل نشان نداد. نتایج متناقض در جمعیت های مختلف با فراوانی آللی متفاوت در بیماران با سقط مکرر خودبخودی و کنترل ممکن است برگرفته از دو عامل اصلی همچون تنوع قومیتی و حجم نمونه در این مطالعات باشد.
هدف :ریسک پلی مورفیسم های ژن KDRدر زنان ایرانی با سقط مکرر ایدیوپاتیک مورد بررسی قرار گرفته است.
مواد و روش ها: مطالعه از نوع مورد-شاهد است. 100 بیمار سقط مکرر خود به خودی ایدیوپاتیک با حداقل دو سقط متوالی قبل از هفته 20 حاملگی با کاریوتیپ نرمال مورد مطالعه قرار گرفت. همچنین 100 زن با حداقل یک حاملگی طبیعی به عنوان گروه کنترل در این مطالعه در نظر گرفته شد. دو SNP عملکردی واقع در ژنKDR شامل rs1870377 (Q472H) و (rs2305948 (V297I و همچنین یک SNP tag در اینترون (rs6838752) توسط واکنش زنجیره ایی پلی مرازی بر پایه چند شکلی طول قطعه محدودالاثر (PCR-RFLP) مورد تجزیه و تحلیل ژنوتایپی قرار گرفت. فراوانی هاپلوتایپ ها برای ژنوتیپ های سه SNP برآورد شد. تجزیه و تحلیل ساختار ژنتیکی و خوشه بندی K-means به منظور بررسی تنوع ژنتیکی انجام شد.
نتایج: SNPعملکردی (rs1870377)پیوستگی بالایی با(rs6838752) tag SNP (D´ value=0.214; χ2 = 16.44 p=0.000) نشان داد. خوشه بندی K-means K=8 را به عنوان بهترین تعداد زیر گروه های ژنتیکی ایده ال برای نمونه های مورد مطالعه شبیه به نتایج تجزیه و تحلیل خوشه ای Neighbor Joining نشان داد.
نتیجه گیری: در این مطالعه، فراوانی آللی و ژنوتیپی ارتباطی با سقط مکرر خودبخودی بین افراد بیمار و کنترل نشان نداد. نتایج متناقض در جمعیت های مختلف با فراوانی آللی متفاوت در بیماران با سقط مکرر خودبخودی و کنترل ممکن است برگرفته از دو عامل اصلی همچون تنوع قومیتی و حجم نمونه در این مطالعات باشد.
نوع مطالعه: Original Article |
فهرست منابع
1. Practice Committee of the American Society for Reproductive Medicine. Definitions of infertility and recurrent pregnancy loss. Fertil Steril 2008; 90: S60. [DOI:10.1016/j.fertnstert.2008.08.065]
2. Sondheimer S: Abortion. Encycl Reprod 1999; 1: 1-6.
3. Clifford K, Rai R, Watson H, Regan L. An informative protocol for the investigation of recurrent miscarriage: preliminary experience of 500 consecutive cases. Hum Reprod 1994; 9: 1328–1332. [DOI:10.1093/oxfordjournals.humrep.a138703]
4. Stirrat GM. Recurrent miscarriage. Lancet 1990; 336: 673–675. [DOI:10.1016/0140-6736(90)92159-F]
5. Su MT, Lin SH, Chen YC. Genetic association studies of angiogenesis- and vasoconstriction-related genes in women with recurrent pregnancy loss: a systematic review and meta-analysis. Hum Reprod Update 2011; 17: 803–812. [DOI:10.1093/humupd/dmr027]
6. Su MT, Lin SH, Lee IW, Chen YC, Kuo PL. Association of polymorphisms/haplotypes of the genes encoding vascular endothelial growth factor and its KDR receptor with recurrent pregnancy loss. Hum Reprod 2011; 26: 758–764. [DOI:10.1093/humrep/deq401]
7. Lee HH, Hong SH, Shin SJ, Ko JJ, Oh D, Kim NK. Association study of vascular endothelial growth factor polymorphisms with the risk of recurrent spontaneous abortion. Fertil Steril 2010; 93: 1244–1247. [DOI:10.1016/j.fertnstert.2008.11.017]
8. Rah H, Jeon YJ, Lee BE, Choi DH, Yoon TK, Lee WS, et al. Association of kinase insert domain-containing receptor (KDR) gene polymorphisms with idiopathic recurrent spontaneous abortion in korean women. Fertil Steril 2013; 99: 753-760. [DOI:10.1016/j.fertnstert.2012.10.038]
9. Park YS, Jeon YJ, Kim HS, Chae KY, Oh SH, Han IB, et al. The role of VEGF and KDR polymorphisms in moyamoya disease and collateral revascularization. PLoS One 2012; 7: e47158. [DOI:10.1371/journal.pone.0047158]
10. An SJ, Chen ZH, Lin QX, Su J, Chen HJ, Lin JY, et al. The- 271 G>A polymorphism of kinase insert domain-containing receptor gene regulates its transcription level in patients with non-small cell lung cancer. BMC Cancer 2009; 9: 144. [DOI:10.1186/1471-2407-9-144]
11. Wang Y, Zheng Y, Zhang W, Yu H, Lou K, Zhang Y, et al. Polymorphisms of KDR gene are associated with coronary heart disease. J Am Coll Cardiol 2007; 50: 760-767. [DOI:10.1016/j.jacc.2007.04.074]
12. Sole´X, Guino´ E, Valls J, Iniesta R, Moreno V. SNPstats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics 2006; 22: 1928–1929. [DOI:10.1093/bioinformatics/btl268]
13. Weising K, Nybom H, Wolf K, Kahl G. DNA Finger Printing in Plants. 2nd Ed. New York; CRC Press, Taylor and Francis; 2005. [DOI:10.1201/9781420040043]
14. Freeland JR, Kirk H, Peterson, S.D. Molecular Ecology . 2nd Ed. UK; Wiley-Blackwell; 2011. [DOI:10.1002/9780470979365]
15. Peakall R, Smouse PE. GENALEX 6: genetic analysis in excel. population genetic software for teaching and research. Mol Ecol Notes 2006; 6: 288- 295. [DOI:10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x]
16. Earl, DA, von Holdt BM. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conserv Genet Resour 2012; 4: 359-361. [DOI:10.1007/s12686-011-9548-7]
17. Evanno G, Regnaut S, Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol Ecol 2005; 14: 2611-2620. [DOI:10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x]
18. Calinski R, Harabasz J. A dendrite method for cluster analysis. Commun Stat 1974; 3: 1-27.
19. Schwarz G. Estimating the dimension of a model. Ann Stat 1978; 6: 461-464. [DOI:10.1214/aos/1176344136]
20. Meirmans PG, Van Tienderen PH. GENOTYPE and GENODIVE: two programs for the analysis of genetic diversity of asexual organisms. Mol Ecol Notes 2004; 4: 792-794. [DOI:10.1111/j.1471-8286.2004.00770.x]
21. Greene JM, Dunaway CW, Bowers SD, Rude BJ, Feugang JM, Ryan PL. In vivo monitoring of fetoplacental Vegfr2 gene activity in a murine pregnancy model using a Vegfr2-luc reporter gene and bioluminescent imaging. Reprod Biol Endocrinol 2011; 9: 51. [DOI:10.1186/1477-7827-9-51]
22. Bogic LV, Brace RA, Cheung CY. Developmental expression of vascular endothelial growth factor (VEGF) receptors and VEGF binding in ovine placenta and fetal membranes. Placenta 2001; 22: 265–275. [DOI:10.1053/plac.2001.0627]
23. Sugino N, Kashida S, Karube-Harada A, Takiguchi S, Kato H. Expression of vascular endothelial growth factor (VEGF) and its receptors in human endometrium throughout the menstrual cycle and in early pregnancy. Reproduction 2002; 123: 379–387. [DOI:10.1530/rep.0.1230379]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
