International Journal of Reproductive BioMedicine

en ارتباط پلی مورفیسم/هاپلوتایپ های ژن KDR با سقط مکرر خودبخودی و ساختار ژنتیکی Association of kinase insert domain-containing receptor (KDR) gene polymorphism/ haplotypes with recurrent spontaneous abortion and genetic structure Original Article Original Article مقدمه: سقط مکرر خودبخودی یکی از بیماری هایی است که می تواند باعث ایجاد مشکلات جسمی، روانی و اقتصادی برای افراد و جامعه شود. به تازگی تعدادی از پلی مورفیسم های ژن گیرنده دومین داخلی کینازی (KDR) که می تواند باعث به خطر افتادن جنین مادران باردار شود مورد بررسی قرار گرفته است. هدف :ریسک پلی مورفیسم های ژن  KDRدر زنان ایرانی با سقط مکرر ایدیوپاتیک مورد بررسی قرار گرفته است. مواد و روش ها: مطالعه از نوع مورد-شاهد است. 100 بیمار سقط مکرر خود به خودی ایدیوپاتیک با حداقل دو سقط متوالی قبل از هفته 20 حاملگی با کاریوتیپ نرمال مورد مطالعه قرار گرفت. همچنین 100 زن با حداقل یک حاملگی طبیعی به عنوان گروه کنترل در این مطالعه در نظر گرفته شد. دو SNP عملکردی واقع در ژنKDR  شامل rs1870377 (Q472H) و (rs2305948 (V297I و همچنین یک SNP tag در اینترون (rs6838752) توسط واکنش زنجیره ایی پلی مرازی بر پایه چند شکلی طول قطعه محدودالاثر (PCR-RFLP) مورد تجزیه و تحلیل ژنوتایپی قرار گرفت. فراوانی هاپلوتایپ ها برای ژنوتیپ های سه SNP برآورد شد. تجزیه و تحلیل ساختار ژنتیکی و خوشه بندی K-means به منظور بررسی تنوع ژنتیکی انجام شد. نتایج:  SNPعملکردی  (rs1870377)پیوستگی بالایی با(rs6838752) tag SNP (D´ value=0.214; χ2 = 16.44 p=0.000) نشان داد. خوشه بندی K-means K=8 را به عنوان بهترین تعداد زیر گروه های ژنتیکی ایده ال برای نمونه های مورد مطالعه شبیه به نتایج تجزیه و تحلیل خوشه ای Neighbor Joining نشان داد. نتیجه گیری: در این مطالعه، فراوانی آللی و ژنوتیپی ارتباطی با سقط مکرر خودبخودی بین افراد بیمار و کنترل نشان نداد. نتایج متناقض در جمعیت های مختلف با فراوانی آللی متفاوت در بیماران با سقط مکرر خودبخودی و کنترل ممکن است برگرفته از دو عامل اصلی همچون تنوع قومیتی و حجم نمونه در این مطالعات باشد. Background: Recurrent spontaneous abortion is one of the diseases that can lead to physical, psychological, and, economical problems for both individuals and society. Recently a few numbers of genetic polymorphisms in kinase insert domain-containing receptor (KDR) gene are examined that can endanger the life of the fetus in pregnant women. Objective: The risk of KDR gene polymorphisms was investigated in Iranian women with idiopathic recurrent spontaneous abortion (RSA). Materials and Methods: A case controlled study was performed. One hundred idiopathic recurrent spontaneous abortion patients with at least two consecutive pregnancy losses before 20 weeks of gestational age with normal karyotypes were included in the study. Also, 100 healthy women with at least one natural pregnancy were studied as control group. Two functional SNPs located in KDR gene; rs1870377 (Q472H), and rs2305948 (V297I) as well as one tag SNP in the intron region (rs6838752) were genotyped by using PCR based restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique. Haplotype frequency was determined for these three SNPs’ genotypes. Analysis of genetic STRUCTURE and K means clustering were performed to study genetic variation. Results: Functional SNP (rs1870377) was highly linked to tag SNP (rs6838752) (D´ value=0. 214; χ2 = 16.44, p<0. 001). K means clustering showed that k = 8 as the best fit for the optimal number of genetic subgroups in our studied materials. This result was in agreement with Neighbor Joining cluster analysis. Conclusion: In our study, the allele and genotype frequencies were not associated with RSA between patient and control individuals. Inconsistent results in different populations with different allele frequencies among RSA patients and controls may be due to ethnic variation and used sample size.   سقط, ساختار ژنتیکی, پلی مورفیسم, RFLP, گیرنده 2 VEGF. Abortion,Genetic structures,Polymorphism,Restriction fragment length polymorphism,VEGF receptor 2 755 764 http://ijrm.ir/browse.php?a_code=A-10-1-178&slc_lang=en&sid=1 Shiva Shahsavari شیوا شهسواری No Department of Biology, School of Sciences, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران Zahra Noormohammadi زهرا نورمحمدی marjannm@yahoo.com Yes Department of Biology, School of Sciences, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران Shohreh Zare Karizi شهره زارع کاریزی No Department of Biology, Pishva Branch, Islamic Azad University, Varamin, Iran گروه زیست شناسی، واحد پیشوا، دانشگاه آزاد اسلامی، ورامین، ایران