دوشنبه 16 مهر 1403
[Archive]
دوره 21، شماره 10 - ( 8-1402 )
جلد 21 شماره 10 صفحات 818-809 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Asadzadeh A, Ghorbani N, Dastan K. Identification of druggable hub genes and key pathways associated with cervical cancer by protein-protein interaction analysis: An in silico study. IJRM 2023; 21 (10) :809-818
URL: http://ijrm.ir/article-1-3133-fa.html
URL: http://ijrm.ir/article-1-3133-fa.html
شناسایی ژن های هاب داروپذیر و مسیرهای کلیدی مرتبط با سرطان دهانه رحم با تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین پروتئین: یک مطالعه in silico. International Journal of Reproductive BioMedicine. 1402; 21 (10) :809-818
چکیده: (434 مشاهده)
مقدمه: رشد کنترل نشده سلولهای غیرطبیعی در دهانه رحم منجر به شروع سرطان دهانه رحم، چهارمین سرطان شایع زنان میشود. تاکنون مطالعات زیادی بر روی سرطان دهانه رحم انجام شده است، با این حال، کشف ژنهای هاب، مسیرهای کلیدی و مکانیسمهای دقیق ایجاد این بیماری ضروری به نظر میرسد.
هدف: هدف از این مطالعه استفاده از الگوهای بیان ژن و آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) برای شناسایی مسیرهای کلیدی و ژنهای هاب داروپذیر در درمان سرطان دهانه رحم میباشد.
مواد و روش ها: در این آنالیز in silico، دو مجموعه داده بیان ژن ریزآرایه GSE63514 (104 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) و GSE9750 (42 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) از سایت (GEO) Gene Expression Omnibus برای شناسایی ژنهای مشترک با بیان متفاوت در آنها، استفاده شد. تجزیه و تحلیل مسیر GO و KEGG از طریق پایگاه داده Enrichr انجام شد. پایگاه داده12.0 STRING و پلاگین cytoHubba در نرمافزار 3.9.1 Cytoscape برای ایجاد و تجزیه و تحلیل شبکه برهمکنش PPI به کار برده شد. در نهایت، ژنهای هاب داروپذیر غربال شد.
نتایج: پس از غربالگری شبکه برهمکنش PPI بر اساس degree توسط پلاگین cytoHubba، 10 ژن به عنوان ژنهای هاب مرتبط با سرطان دهانه رحم شناسایی شدند که شامل NCAPG، KIF11، TTK، PBK، MELK، ASPM،TPX2 ، BUB1، TOP2A و KIF2C میباشند. در میان این ژنهای هاب، 5 ژن (KIF11، TTK، PBK، MELK و TOP2A) داروپذیر هستند.
نتیجه گیری: این تحقیق چشماندازی جدید برای طراحی اهداف درمانی در بیماران مبتلا به سرطان دهانه رحم ارائه میدهد. با این حال، این یافتهها باید از طریق آزمایشهای بیشتر تأیید شود.
هدف: هدف از این مطالعه استفاده از الگوهای بیان ژن و آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) برای شناسایی مسیرهای کلیدی و ژنهای هاب داروپذیر در درمان سرطان دهانه رحم میباشد.
مواد و روش ها: در این آنالیز in silico، دو مجموعه داده بیان ژن ریزآرایه GSE63514 (104 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) و GSE9750 (42 نمونه سرطان و 24 نمونه طبیعی) از سایت (GEO) Gene Expression Omnibus برای شناسایی ژنهای مشترک با بیان متفاوت در آنها، استفاده شد. تجزیه و تحلیل مسیر GO و KEGG از طریق پایگاه داده Enrichr انجام شد. پایگاه داده12.0 STRING و پلاگین cytoHubba در نرمافزار 3.9.1 Cytoscape برای ایجاد و تجزیه و تحلیل شبکه برهمکنش PPI به کار برده شد. در نهایت، ژنهای هاب داروپذیر غربال شد.
نتایج: پس از غربالگری شبکه برهمکنش PPI بر اساس degree توسط پلاگین cytoHubba، 10 ژن به عنوان ژنهای هاب مرتبط با سرطان دهانه رحم شناسایی شدند که شامل NCAPG، KIF11، TTK، PBK، MELK، ASPM،TPX2 ، BUB1، TOP2A و KIF2C میباشند. در میان این ژنهای هاب، 5 ژن (KIF11، TTK، PBK، MELK و TOP2A) داروپذیر هستند.
نتیجه گیری: این تحقیق چشماندازی جدید برای طراحی اهداف درمانی در بیماران مبتلا به سرطان دهانه رحم ارائه میدهد. با این حال، این یافتهها باید از طریق آزمایشهای بیشتر تأیید شود.
نوع مطالعه: Original Article |
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
