دوره 10، شماره 6 - ( 1-1391 )                   جلد 10 شماره 6 صفحات 530-523 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Davoudi A, Tarang A, Aleyasin S A, Salehi A, Seighalani R, Tahmoressi F. Evaluation of two DNA extraction methods from maternal plasma for using in non-invasive bovine fetus gender determination. IJRM 2012; 10 (6) :523-530
URL: http://ijrm.ir/article-1-332-fa.html
داودی آرش، ترنگ علیرضا، آل یاسین سیداحمد، صالحی عبدالرضا، صیقلانی رامین، طهمورسی فریده. ارزیابی دو روش استخراج DNA از پلاسمای مادری برای استفاده در تعیین جنسیت غیرتهاجمی جنین گاو. International Journal of Reproductive BioMedicine. 1391; 10 (6) :523-530

URL: http://ijrm.ir/article-1-332-fa.html

ارزیابی دو روش استخراج DNA از پلاسمای مادری برای استفاده در تعیین جنسیت غیرتهاجمی جنین گاو
آرش داودی* 1، علیرضا ترنگ2 ، سیداحمد آل یاسین3 ، عبدالرضا صالحی4 ، رامین صیقلانی5 ، فریده طهمورسی6
1- بخش ژنومیکس و جانوری، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران ( ABRII)، منطقه شمال کشور، رشت، ایران ، arash1983@gmail.com
2- بخش ژنومیکس و جانوری، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ABRII)، منطقه شمال کشور، رشت، ایران
3- پژوهشکده بیتکنولوژی پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری ( NIGEB )، تهران، ایران
4- بخش علوم دامی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران، ایران
5- بخش ژنومیکس و جانوری، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران ( ABRII)، منطقه شمال کشور، رشت، ایران
6- بخش ژنومیکس و جانوری، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران ( ABRII )، منطقه شمال کشور، رشت، ایران
چکیده:   (2944 مشاهده)
مقدمه: DNA جنینی در پلاسما و سرم مادری بهعنوان یک ماده مفید برای تعیین جنسیت جنین قبل از تولد در طول سنین اولیه حاملگی نشان داده شده
است. اکنون روشهای غیرتهاجمی تشخیص پیش از تولد از هفته هشتم بارداری، با آزمایش نمونه خون مادری امکانپذیر است.
هدف: هدف از این مطالعه مقایسه دو روش استخراج DNA از پلاسمای مادری و به کارگیری آن در تستهای کلینیکی روتین جهت تعیین جنسیت جنین با
استفاده از روش غیرتهاجمی است.
مواد و روش ها: نمونههای خون مادری از 04 گاو آبستن که در طی هفتههای 8 تا 88 بارداری بودند جمع آوری شد. DNA الگو از 854 میکرولیتر
پلاسمای مادری با استفاده از دو روش نمکی و فنل کلروفرم استخراج گردید. جذب در - A260 و خلوص ) A260/A280 ) DNA استخراج شده بوسیله
اسپکتروفتومتر تعیین شد. سه میکرولیتر DNA استخراج شده بوسیله روش فنل کلروفرم بعنوان - DNA الگو مورد استفاده قرار گرفت. واکنش PCR برای
تکثیر قطعات کروموزومی X و Y ژنهای آمیلوژنین، TSPY و BC1.2 بهینه و تنظیم شد.
نتایج: تفاوت بین میانگین جذب DNA استخراج شده بوسیله روشهای فنل کلروفرم و نمکی در A260 <4/ معنی دار نبود ) 45 p (، درحالیکه، اختلاف بین
میانگین خلوص ) A260/A280 ) DNA <4/ استخراج شده بوسیله روشهای فنل کلروفرم و نمکی معنی دار بود ) 440 p (. قطعه کروموزوم X در تمامی 04 نمونه
و قطعات کروموزومی Y در 55 نمونه پلاسمایی گاوهایی که گوساله نر باردار بودند تشخیص داده شد. حساسیت و اختصاصیت این تست 044 درصد و بدون هیچ
نتایج منفی و مثبت کاذب مشخص شد.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که روش فنل کلروفرم روشی ساده و موثر برای جداسازی و تفکیک DNA جنینی از پلاسمای مادری است.
واژه‌های کلیدی: استخراج DNA، پلاسمای مادری، جنین، تعیین جنسیت، غیر تهاجمی
متن کامل مقاله [PDF 580 kb]   (555 دریافت)    
نوع مطالعه: Original Article |
فهرست منابع
1. Lo YM, Corbetta N, Chamberlain PF, Rai V, Sargent IL, Redman CW, et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum. Lancet 1997; 350: 485-487. [DOI:10.1016/S0140-6736(97)02174-0]
2. Lo YM, Tein MS, Lau TK, Haines CJ, Leung TN, Poon PM, et al. Quantitative analysis of fetal DNA in maternal plasma and serum: implication for noninvasive prenatal diagnosis. Am J Hum Genet 1998; 62: 768-775. [DOI:10.1086/301800]
3. Lo YM, Zhang J, Leung TN, Lau TK, Chang AM, Hjelm NM. Rapid clearance of fetal DNA from maternal plasma. Am J Hum Genet 1999; 64: 218-224. [DOI:10.1086/302205]
4. Houfflin-Debarge V, O'Donnell H, Overton T, Bennett PR, Fisk NM. High sensitivity of fetal DNA in plasma compared to serum and nucleated cells using unnested PCR in maternal blood. Fetal Diagn Ther 2000; 15: 102-107. [DOI:10.1159/000020985]
5. Jen J, Wu L, Sidransky D. An overview on the isolation and analysis of circulating tumor DNA in plasma and serum. Ann N Y Acad Sci 2000; 906: 8-12. [DOI:10.1111/j.1749-6632.2000.tb06581.x]
6. Lui YY, Dennis YM. Circulating DNA in plasma and serum: biology preanalytical issues and diagnostic applications. Clin Chem Lab Med 2002; 40: 962-968. [DOI:10.1515/CCLM.2002.169]
7. Chiu RW, Poon LL, Lau TK, Leung TN, Wong EM, Lo YM. Effects of blood-processing protocols on fetal and total DNA quantification in maternal plasma. Clin Chem 2001; 47: 1607-1613.
8. Bayrak-Toydemir P, Pergament E, Fiddler M. Are fetal cells in maternal plasma really there? We think they are. J Hum Genet 2003; 48: 665-667. [DOI:10.1007/s10038-003-0084-5]
9. Bischoff FZ, Hahn S, Johnson KL, Simpson JL, Bianchi DW, Lewis DE, et al. Intact fetal cells in maternal plasma: are they really there? Lancet 2003; 361: 139-140. [DOI:10.1016/S0140-6736(03)12191-5]
10. Kolialexi A, Tsangaris GT, Mavrou A, Antsaklis A, Tzortzatou F, Touliatou V, et al. Use of annexin V antibody to identify apoptotic cells during pregnancy. Ann N Y Acad Sci 2001; 945: 145-150. [DOI:10.1111/j.1749-6632.2001.tb03876.x]
11. Lo YM, Patel P, Wainscoat JS, Sampietro M, Gillmer MD, Fleming KA. Prenatal sex determination by DNA amplification from maternal peripheral blood. Lancet 1998; 2: 1363-1365.
12. Lo YM, Hjelm NM, Fidler C, Sargent IL, Murphy MF, Chamberlain PF, et al. Prenatal diagnosis of fetal RhD status by molecular analysis of maternal plasma. N Engl J Med 1998; 339: 1734-1738. [DOI:10.1056/NEJM199812103392402]
13. Zhong XY, Holzgreve W, Hahn S. Detection of fetal Rhesus and sex using fetal DNA from maternal plasma by multiplex polymerase chain reaction. BJOG 2000; 107: 766-769. [DOI:10.1111/j.1471-0528.2000.tb13338.x]
14. Zhong XY, Holzgreve W, Hahn S. Risk free simultaneous prenatal identification of fetal Rhesus D status and sex by multiplex real-time PCR using cell free fetal DNA in maternal plasma. Swiss Med Wkly 2001; 131: 70-74.
15. González-González C, Garcia-Hoyos M, Trujillo-Tiebas MJ, Lorda-Sanchez I, de Alba MR, Infantes F, et al. Application of Fetal DNA Detection in Maternal Plasma: A Prenatal Diagnosis Unit Experience. J Histochem Cytochem 2005; 53: 307-314. [DOI:10.1369/jhc.4A6400.2005]
16. Angert RM, LeShane ES, Lo YM, Chan LY, Delli-Bovi LC, Bianchi DW. Fetal cell-free plasma DNA concentrations in maternal blood are stable 24 hours after collection: analysis of first- and thirdtrimester samples. Clin Chem 2003; 49: 195-198. [DOI:10.1373/49.1.195]
17. Zhao Y, Zou L. Application of fetal DNA in maternal plasma in noninvasive prenatal diagnosis. J Huazhong Univ Sci Technolog Med Sci 2004; 24: 59-61. [DOI:10.1007/BF02830707]
18. Akolekar R, Farkas DH, Van Agtmael AL, Bombard AT, Nicolaides KH. Fetal sex determination using circulating cell-free fetal DNA (ccffDNA) at 11 to 13 weeks of gestation. Prenat Diagn 2010; 30: 918-923. [DOI:10.1002/pd.2582]
19. Hahn S, Sant R, Holzgreve W. Fetal cells in maternal blood: current and future perspectives. Mol Hum Reprod 1998; 4: 515-521. [DOI:10.1093/molehr/4.6.515]
20. Bischoff FZ, Sinacori MK, Dang DD, Marquez-Do D, Horne C, Lewis DE, et al. Cell-free fetal DNA and intact fetal cells in maternal blood circulation: implications for first and second trimester non-invasive prenatal diagnosis. Hum Reprod Update 2002; 8: 493-500. [DOI:10.1093/humupd/8.6.493]
21. Kim SH, Bianchi DW, Cha DH. Non-invasive prenatal diagnosis using cell-free nucleic acids in maternal blood. J Women's Med 2010; 3: 35-42. [DOI:10.5468/jwm.2010.3.2.35]
22. Costa JM, Benachi A, Gautier E, Jouannic JM, Ernault P, Dumez Y. First-trimester fetal sex determination in maternal serum using real-time PCR. Prenat Diagn 2001; 21: 1070-1074. [DOI:10.1002/pd.219]
23. Honda H, Miharu N, Ohashi Y, Ohama K. successful diagnosis of fetal gender using conventional PCR analysis of maternal serum. Clin Chem 2001; 47:41-46.
24. Honda H, Miharu N, Ohashi Y, Samura O, Kinutani M, Hara T , et al. Fetal gender determination in early pregnancy through qualitative and quantitative analysis of fetal DNA in maternal serum. Hum Genet 2002; 110: 75-79. [DOI:10.1007/s00439-001-0649-3]
25. Hamada H, Arinami T, Kubo T, Hamaguchi H, Iwasaki H. Fetal nucleated cells in maternal peripheral blood: frequency and relationship to gestational age. Hum Genet 1993; 91: 427-432. [DOI:10.1007/BF00217766]
26. Pertl B, Sekizawa A, Samura O, Orescovic I, Rahaim PT, Bianchi DW. Detection of male and female fetal DNA in maternal plasma by multiplex fluorescens polymerase chain reaction amplification of short tandem repeats. Hum Genet 2000; 106: 45-49. [DOI:10.1007/s004390051008]
27. Falcinelli C, Battafarano S, Neri C, Mazza V, Ranzi A, Volpe A, et al. First-trimester fetal sex prediction by deoxyribonucleic acid analysis of maternal peripheral blood. Am J Obstet Gynecol 1999; 181: 675-680. [DOI:10.1016/S0002-9378(99)70512-0]
28. Al-Yatama MK, Mustafa AS, Ali S, Abraham S, Khan Z, Khaja N. Detection of Y chromosome-specific DNA in the plasma and urine of pregnant women using polymerase chain reaction. Prenat Diagn 2001; 21: 399-402. [DOI:10.1002/pd.69]
29. Wang G, Cui Q, Cheng K, Zhang X, Xing G, Wu S. Prediction of fetal sex by amplification of fetal DNA present in cow plasma. J Reprod Dev 2010; 56: 639-642. [DOI:10.1262/jrd.10-010T]
30. Tufan NLS, Tufan AC, Kalel B, Yildirim B, Semerki CN, Bauci H. Analysis of Cell-Free Fetal DNA from Maternal Plasma and Serum Using a Conventional Multiplex PCR: Factors Influencing Success. Turk J Med Sci 2005; 35: 85-92.
31. Deng Z, Wu G, Li Q, Zhang X, Liang Y, Li D, et al. Nonivasive genotyping of 9 Y-chromosame specific STR loci using circulating fetal DNA in maternal plasma by multiplex PCR. Prenat Diagn 2006; 26: 362-368. [DOI:10.1002/pd.1422]
32. Hromadnikova I, Houbova B, Hridelova D, Voslarova S, Kofer J, Komrska V, et al. Replicate real-time PCR testing of DNA in maternal plasma increases the sensitivity of non-invasive fetal sex determination. Prenat Diagn 2003; 23: 235-238. [DOI:10.1002/pd.556]
33. Sekizawa A, Kondo T, Iwasaki M, Watanabe A, Jimbo M, Saito H, et al. Accuracy of fetal gender determination by analysis of DNA in maternal plasma. Clin Chem 2001; 47: 1856-1858.
34. Tungwiwat W, Fucharoen G, Ratanasiri T, Sanchaisuriya K, Fucharoen S. Non-invasive fetal sex determination using a conventional nested PCR analysis of fetal DNA in maternal plasma. Clin Chim Acta 2003; 334: 173-177. [DOI:10.1016/S0009-8981(03)00224-9]
35. Dhallan R, Au WC, Mattagajasingh S, Emche S, Bayliss P, Damewood M, et al. Methods to increase the percentage of free fetal DNA recovered from the maternal circulation. JAMA 2004; 291: 1114-1119. [DOI:10.1001/jama.291.9.1114]
36. Chen CM, Hu CL, Wang CH, Hung CM, Wu HK, Choo KB, et al. Gender determination in single bovine blastomeres by polymerase chain reaction amplification of sex-specific polymorphic fragments in the amelogenin gene. Mol Reprod Dev 1999; 54: 209-214. https://doi.org/10.1002/(SICI)1098-2795(199911)54:3<209::AID-MRD1>3.0.CO;2-6 [DOI:10.1002/(SICI)1098-2795(199911)54:33.0.CO;2-6]
37. Cotinot C, Kirszenbaum M, Leonard M, Gianquinto L, Vaiman M. Isolation of bovine Y-derived sequence: potential use in embryo sexing. Genomics 1991; 10: 646-653. [DOI:10.1016/0888-7543(91)90447-M]
38. Lemos DC, Rios FL, Caetano RB, Lôbo RA, Vila LM, Takeuchi PL, Ramos ES. Use of the TSPY gene for sexing cattle. Genet Mol Biol 2005; 28: 117-119. [DOI:10.1590/S1415-47572005000100020]
39. Lemos DC, Takeuchi PL, Rios AFL, Araujo A, Lemos HC, Ramos ES. Bovine fetal DNA in maternal circulation: Apllications and implications. Placenta 2011; 32: 912-913. [DOI:10.1016/j.placenta.2011.07.088]
40. Kadokawa H, Takusari N, Minezawa M, Takahashi H, Kariya T. Absence of fetal cells in bovine Jugular and Uterine Vein blood at a Level of 1 in 10, 000. J Reprod Develop 1996; 42: 205-208. [DOI:10.1262/jrd.42.205]
41. Yang J, Wang L, Jiang X, Jiang Y, Liu L. Detection of bovine fetal Y-specific Sry sequence from maternal blood. Chin J Biotechnol 1996; 12: 185-188.
42. Hiendleder S, Bebbere D, Zakhartchenko V, Reichenbach HD, Wenigerkind H, Ledda S, et al. Maternal-fetal transplacental leakage of mitochondrial DNA in bovine nuclear transfer pregnancies: potential implications for offspring and recipients. Cloning stem cells 2004; 6: 150-156. [DOI:10.1089/1536230041372391]
43. Turin L, Invernizzi P, Woodcock M, Grati FR, Riva F, Tribbioli G, et al. Bovine fetal microchimerism in normal and embryo transfer pregnancies and its implications for biotechnology applications in cattle. Biotechnol J 2007; 2: 486-491. [DOI:10.1002/biot.200600218]
44. Wang G, Cui Q, Cheng K, Zhang X, Xing G, Wu S. Prediction of fetal sex by amplification of fetal DNA present in cow plasma. J Reprod Dev 2010; 56: 639-342. [DOI:10.1262/jrd.10-010T]
45. Davoudi A, Seighalani R, Aleyasin SA, Tarang A, Radjabi R, Tahmoressi F. The application of amplified TSPY and amelogenin genes from maternal plasma as a non-invasive bovine fetal DNA diagnosis. Eurasia J Biosci 2011; 5: 119-126. [DOI:10.5053/ejobios.2011.5.0.14]
46. Davoudi A, Seighalani R, Aleyasin SA, Tarang A, Salehi AR, Tahmoressi F. A low-cost efficient multiplex PCR for prenatal sex determination in bovine fetus using free fetal DNA in maternal plasma. Int J Fertil Steril 2012; 6: 45-50
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به International Journal of Reproductive BioMedicine می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | International Journal of Reproductive BioMedicine

Designed & Developed by : Yektaweb