پنجشنبه 30 مرداد 1404
[Archive]
دوره 23، شماره 6 - ( 3-1404 )
جلد 23 شماره 6 صفحات 526-517 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Ethics code: IR.IAU.VARAMIN.REC.1401.006
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ashrafzadeh H, Tafvizi F, Ghasemi N, Vahidi Mehrjardi M Y, Naseh V. Prenatal diagnosis using next-generation sequencing in genetic counseling: Novel mutations in three large Iranian families: A case series. IJRM 2025; 23 (6) :517-526
URL: http://ijrm.ir/article-1-3576-fa.html
URL: http://ijrm.ir/article-1-3576-fa.html
تشخیص پیش از تولد با استفاده از توالی‌یابی نسل جدید در مشاوره ژنتیک: جهش‌های نوظهور در سه خانواده پرجمعیت ایرانی: یک گزارش مورد. International Journal of Reproductive BioMedicine. 1404; 23 (6) :517-526
چکیده: (32 مشاهده)
مقدمه: تعداد قابل توجهی از خانواده‌ها به‌دلیل سابقه خانوادگی مثبت در ابتلا به اختلالات ژنتیکی ناهمگون، به منظور برنامه‌ریزی برای بارداری بعدی، متقاضی مشاوره ژنتیک هستند. تشخیص پیش از تولد با بهره‌گیری از روش‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS) ابزاری قدرتمند برای شناسایی علل ناهنجاری‌های ژنتیکی فراهم می‌آورد که امکان مداخله به‌موقع و تصمیم‌گیری آگاهانه در زمینه فرزندآوری را مهیا می‌سازد. این مطالعه به بررسی توانمندی توالی‌یابی کل اگزوم (WES) در کشف واریانت‌های ژنتیکی در زوج‌هایی می‌پردازد که برای بارداری بعدی خود به مراکز مشاوره ژنتیک مراجعه کرده‌اند.
مورد: در این مطالعه از روش WES جهت شناسایی واریانت‌های ژنتیکی مرتبط با ناتوانی ذهنی و رشدی در خانواده‌های مراجعه‌کننده به مرکز مشاوره ژنتیک استفاده شد. سه خانواده ایرانی که دست‌کم یک فرزند مبتلا به تأخیر تکاملی و یا ناتوانی ذهنی داشتند، برای بهبود نتایج بارداری بعدی به مرکز تحقیقات سقط پژوهشکده علوم تولیدمثل یزد مراجعه کردند. در پی بررسی‌های ژنتیکی فرزندان مبتلا در هر خانواده، سه جهش متفاوت شناسایی شد. نتایج به ترتیب شامل یک جهش ختم رونویسی هموزیگوت de novo در ژن malate dehydrogenase 1 (MDH1) (NM_005917.4:c.4C>T; p.Arg2Ter)، یک جهش در محل پذیرنده اسپلایس در ژن PGAP1 (NM_024989.4:c.1221-1G>T)، و یک جهش missense در ژنLYST (NM_000081.4:c.949G>A; p.Glu317Lys) بود.
نتیجه گیری: WES روشی تشخیصی موفق در موارد تأخیر تکاملی و ناتوانی ذهنی بدون علت مشخص محسوب می‌شود. وجود ناهمگونی ژنتیکی گسترده در خانواده‌های پرجمعیت ایرانی، اهمیت ویژه واریانت‌های de novo را در تشخیص تقویت می‌کند. یافته‌های این مطالعه نقش ژن‌های PGAP1، MDH1 و LYST را در پاتوفیزیولوژی ناتوانی ذهنی و تأخیر رشدی تأیید می‌کند و ظرفیت بالقوه غربالگری ژنتیکی پیش از تولد را در اصلاح روند مشاوره ژنتیک نشان می‌دهد.
مورد: در این مطالعه از روش WES جهت شناسایی واریانت‌های ژنتیکی مرتبط با ناتوانی ذهنی و رشدی در خانواده‌های مراجعه‌کننده به مرکز مشاوره ژنتیک استفاده شد. سه خانواده ایرانی که دست‌کم یک فرزند مبتلا به تأخیر تکاملی و یا ناتوانی ذهنی داشتند، برای بهبود نتایج بارداری بعدی به مرکز تحقیقات سقط پژوهشکده علوم تولیدمثل یزد مراجعه کردند. در پی بررسی‌های ژنتیکی فرزندان مبتلا در هر خانواده، سه جهش متفاوت شناسایی شد. نتایج به ترتیب شامل یک جهش ختم رونویسی هموزیگوت de novo در ژن malate dehydrogenase 1 (MDH1) (NM_005917.4:c.4C>T; p.Arg2Ter)، یک جهش در محل پذیرنده اسپلایس در ژن PGAP1 (NM_024989.4:c.1221-1G>T)، و یک جهش missense در ژنLYST (NM_000081.4:c.949G>A; p.Glu317Lys) بود.
نتیجه گیری: WES روشی تشخیصی موفق در موارد تأخیر تکاملی و ناتوانی ذهنی بدون علت مشخص محسوب می‌شود. وجود ناهمگونی ژنتیکی گسترده در خانواده‌های پرجمعیت ایرانی، اهمیت ویژه واریانت‌های de novo را در تشخیص تقویت می‌کند. یافته‌های این مطالعه نقش ژن‌های PGAP1، MDH1 و LYST را در پاتوفیزیولوژی ناتوانی ذهنی و تأخیر رشدی تأیید می‌کند و ظرفیت بالقوه غربالگری ژنتیکی پیش از تولد را در اصلاح روند مشاوره ژنتیک نشان می‌دهد.
نوع مطالعه: Case Report |
فهرست منابع
1. Schmidt JL, Maas R, Altmeyer SR. Genetic counseling for consumer‐driven whole exome and whole genome sequencing: A commentary on early experiences. J Genet Couns 2019; 28: 449-455. [DOI:10.1002/jgc4.1109] [PMID]
2. Li P, Xu F, Shu W. The spectrum of cytogenomic abnormalities in patients with developmental delay and intellectual disabilities. N A J Med Sci 2015; 8: 172-178.
3. Chai H, DiAdamo A, Grommisch B, Boyle J, Amato K, Wang D, et al. Integrated FISH, karyotyping and aCGH analyses for effective prenatal diagnosis of common aneuploidies and other cytogenomic abnormalities. Med Sci 2019; 7: 16. [DOI:10.3390/medsci7020016] [PMID] [PMCID]
4. Harripaul R, Noor A, Ayub M, Vincent JB. The use of next-generation sequencing for research and diagnostics for intellectual disability. Cold Spring Harb Perspect Med 2017; 7: a026864. [DOI:10.1101/cshperspect.a026864] [PMID] [PMCID]
5. Peterlin A, Peterlin B. Contemporary approach to diagnosis of genetic causes of intellectual disability. J Spec Educ Rehab 2016; 17: 62-70. [DOI:10.19057/jser.2016.10]
6. Muthusamy B, Selvan LDN, Nguyen TT, Manoj J, Stawiski EW, Jaiswal BS, et al. Next-generation sequencing reveals novel mutations in X-linked intellectual disability. Omics 2017; 21: 295-303. [DOI:10.1089/omi.2017.0009] [PMID] [PMCID]
7. Schwarz JM, Cooper DN, Schuelke M, Seelow D. Mutation taster 2: Mutation prediction for the deep-sequencing age. Nat Methods 2014; 11: 361-362. [DOI:10.1038/nmeth.2890] [PMID]
8. Kircher M, Witten DM, Jain P, O'roak BJ, Cooper GM, Shendure J. A general framework for estimating the relative pathogenicity of human genetic variants. Nat Genet 2014; 46: 310-315. [DOI:10.1038/ng.2892] [PMID] [PMCID]
9. Jagadeesh KA, Wenger AM, Berger MJ, Guturu H, Stenson PD, Cooper DN, et al. M-CAP eliminates a majority of variants of uncertain significance in clinical exomes at high sensitivity. Nat Genet 2016; 48: 1581-1586. [DOI:10.1038/ng.3703] [PMID]
10. Serra-Vinardell J, Sandler MB, De Pace R, Manzella-Lapeira J, Cougnoux A, Keyvanfar K, et al. LYST deficiency impairs autophagic lysosome reformation in neurons and alters lysosome number and size. Cell Mol Life Sci 2023; 80: 53.
https://doi.org/10.1007/s00018-023-04695-x [DOI:10.1007/s00018-023-04724-9] [PMID] [PMCID]
11. Song Y, Dong Z, Luo S, Yang J, Lu Y, Gao B, et al. Identification of a compound heterozygote in LYST gene: A case report on Chediak-Higashi syndrome. BMC Med Genet 2020; 21: 4. [DOI:10.1186/s12881-019-0922-8] [PMID] [PMCID]
12. Acevedo A, Torres F, Kiwi M, Baeza-Lehnert F, Barros LF, Lee-Liu D, et al. Metabolic switch in the aging astrocyte supported via integrative approach comprising network and transcriptome analyses. Aging 2023; 15: 9896. [DOI:10.18632/aging.204663] [PMID] [PMCID]
13. Ait-El-Mkadem S, Dayem-Quere M, Gusic M, Chaussenot A, Bannwarth S, François B, et al. Mutations in MDH2, encoding a Krebs cycle enzyme, cause early-onset severe encephalopathy. Am J Hum Genet 2017; 100: 151-159. [DOI:10.1016/j.ajhg.2016.11.014] [PMID] [PMCID]
14. Zuend M, Saab AS, Wyss MT, Ferrari KD, Hösli L, Looser ZJ, et al. Arousal-induced cortical activity triggers lactate release from astrocytes. Nat Metab 2020; 2: 179-191. [DOI:10.1038/s42255-020-0170-4] [PMID]
15. Chen Z, Yuan Z, Yang S, Zhu Y, Xue M, Zhang J, et al. Brain energy metabolism: Astrocytes in neurodegenerative diseases. CNS Neurosci Ther 2023; 29: 24-36. [DOI:10.1111/cns.13982] [PMID] [PMCID]
16. McNair LM, Andersen JV, Waagepetersen HS. Stable isotope tracing reveals disturbed cellular energy and glutamate metabolism in hippocampal slices of aged male mice. Neurochem Int 2023; 171: 105626. [DOI:10.1016/j.neuint.2023.105626] [PMID]
17. Hanse EA, Ruan C, Kachman M, Wang D, Lowman XH, Kelekar A. Cytosolic malate dehydrogenase activity helps support glycolysis in actively proliferating cells and cancer. Oncogene 2017; 36: 3915-3924. [DOI:10.1038/onc.2017.36] [PMID] [PMCID]
18. Murakami Y, Tawamie H, Maeda Y, Büttner C, Buchert R, Radwan F, et al. Null mutation in PGAP1 impairing Gpi-anchor maturation in patients with intellectual disability and encephalopathy. PLoS Genet 2014; 10: e1004320. [DOI:10.1371/journal.pgen.1004320] [PMID] [PMCID]
19. Kettwig M, Elpeleg O, Wegener E, Dreha-Kulaczewski S, Henneke M, Gärtner J, et al. Compound heterozygous variants in PGAP1 causing severe psychomotor retardation, brain atrophy, recurrent apneas and delayed myelination: A case report and literature review. BMC Neurol 2016; 16: 74. [DOI:10.1186/s12883-016-0602-7] [PMID] [PMCID]
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
